Đầu năm học mới ở trường Ryuuzan, bà Hiệu trưởng thông báo với toàn thể giáo viên là trường học sắp đóng cử và tất cả họ sẽ bị thất nghiệp. Ryuuzan là trường cấp 3 « tệ » nhất ở Tokyo, là nơi « hội tụ » những học sinh lười và dốt. Ko có ai muốn tài trợ cho trường để trả các khoản nợ.
Câu chuyện kể về hai cậu bé sinh đôi được tạo ra từ phòng thí nghiệm bằng phương pháp biến đổi gene. Do được tạo dựng chọn lọc từ những gì tinh túy, cặp sinh đôi này sinh ra với sức mạnh phi thường, quyền năng siêu nhiên và chỉ số IQ cao ngất. Bất hạnh thay, cặp song sinh này được sinh ra từ hai người mẹ mang thai hộ, họ không được biết nhau. Người anh, Arisue Sei, khi lớn lên trở thành một nhà khoa học ngành sinh hóa tại Mỹ. Cậu được phân công tham gia một dự án, đến một hòn đảo nhỏ ở Nhật Bản
Dù chỉ là một học sinh trung học, nhưng với chỉ số IQ 180 cùng với tài năng phá án được thừa hưởng từ ông nội, Hajime Kindaichi luôn được Thanh tra Isamu tin tưởng mời hợp tác điều tra các vụ án ly kì. Sát cánh bên cạnh cậu luôn là cô bạn gái Miyuki và cậu bạn thân Ryuta
Misaki Sakurai (Mirei Kiritani) đã lâu không hẹn hò với ai. Cô chỉ chuyên tâm vào việc làm bánh để bản thân có thể tự mở cửa hàng của riêng mình trong tương lai. Cho đến một ngày, cô bị sa thải, đồng thời gặp lại mối tình đầu thời trung học của mình
Sỹ quan cảnh sát tân binh 20 tuổi vừa tốt nghiệp từ Học viện Cảnh sát Kawai Mai (Nagano Mei) đã được phân bổ đến trạm cảnh sát Machiyama. Lý do Kawai chọn công việc này là vì muốn một cuộc sống ổn định, sau khi trải qua hàng loạt cuộc thi tuyển chọn nhân viên công chức thì chỉ có bên cảnh sát nhận cô.