Batman Beyond được đặt trong bối cảnh thời gian tương lai của vũ trụ hoạt hình DC (mặc dù được phát hành trước Static Shock, Justice League, và Justice League Unlimited), và được coi là phần tiếp theo của cả Batman: The Animated Series và The New Batman Adventures.
Hoàng tử Xie Lian của Vương quốc Xianle sau khi bị giáng chức lần thứ ba, nhưng anh đã vô tình phá hủy ngôi đền vàng của các linh mục, anh chỉ có thể xuống nhân gian để trừ ma để đổi lấy công đức đền bù.
Dân quốc năm thứ sáu, tháng Đinh Mùi, ngày Ất Mão (12/7/1917). Ban đêm, ngoài biển thủy triều dâng lên, trong đêm đó trời và trăng đều cùng soi xuống biển, dị tượng nổi lên khắp nơi. Lúc đó trong thành, khói bụi mù mịt, nhà cửa đổ sập, hàng trăm vạn sinh linh rơi vào cảnh khổ sở vô cùng.
A young Bruce Wayne is in his third year of trying to establish himself as Batman, protector of Gotham City. Living in Gotham, a metropolis where shadows run long and deep, beneath elevated train tracks, this younger Batman will confront each of his familiar foes for the first time.