Đặt trong bối cảnh tương lai xa trên một hành tinh rất xa Trái Đất. Kato Marika là một học sinh thích lái phi thuyền sống cùng mẹ và không biết gì về bố mình. Một ngày nọ cô bé được hai người thông báo về cái chết của bố và sứ mệnh thay thế bố làm hải tặc không gian trên con tàu của ông.
Yusuke Yotsuya là một học sinh lớp 9, sống thực tế, không thân thiện và không hề tham gia bất cứ hoạt động trong CLB nào. Đến một ngày nọ, cậu cùng hai người bạn nữ cùng lớp đã bất ngờ bị chuyển đến một thế giới khác, nơi mà họ phải hợp tác với nhau để chống chọi lại cuộc sống ở thế giới mới
Sự kiện bắt đầu bằng việc 7 đứa trẻ đi chơi núi nhưng đột nhiên họ bị hút vào 1 thế giới khác . Ở đó họ trở thành “những đứa trẻ của định mệnh” và mỗi nguời đều có 1 con thú Digimon bên mình và cả bọn phải chống lại thế lực tà ác do các Digimon xấu gây nên
Câu chuyện xảy ra vào 20 năm đầu của Thiếu Niên Ca Hành, khi đó Bách Lý Đông Quân vẫn còn là một độc tôn được nhận vô vàng sủng ái của Trấn Tây Hầu phủ. Tuy hắn có phụ thân võ công tuyệt thế và mẫu thân gia chủ Ôn gia, nhưng lại không thích tập võ, chỉ yêu thích chưng cất rượu
Câu chuyện xoay quanh Sagara Sousuke - 1 chàng trung sĩ trẻ tuổi của tổ chức Mithril - được giao nhiệm vụ bảo vệ Kaname Chidori - 1 cô nữ sinh trung học - và mọi chuyện rắc rối xảy ra từ đây